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Science

Pflanzen und ihr Mikrokosmos

TRR356 PlantMicrobe Outreach

Willkommen in der faszinierenden Welt von Pflanzen und Mikroorganismen!

In diesem Podcast beleuchten wir die neuesten Forschungserkenntnisse rund um das Wechselspiel von Pflanzen mit ihren mikroskopischen Partnern. Zu Gast sind neben Forschenden des DFG-geförderten Verbunds TRR356 PlantMicrobe auch Studierende, Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler aus angrenzenden Fachgebieten sowie Expertinnen und Experten der Wissenschaftskommunikation, die vielfältige Perspektiven auf Forschung und deren Vermittlung einbringen. Gemeinsam sprechen wir über spannende Pflanzen-Mikroben-Beziehungen und die Rolle genetischer Vielfalt. Denn obwohl unsichtbar für das bloße Auge, tummeln sich unzählige Kleinstlebewesen in und um Pflanzen. Sie beeinflussen ihr Wachstum, ihre Gesundheit und ihre Widerstandsfähigkeit – und somit auch unsere Ernährung und Lebensgrundlage.

Moderiert von Dr. Dagmar Hann, Biologin am Institut für Genetik der Ludwig-Maximilians-Universität München, bietet der Podcast Einblicke in die einzelnen Forschungsprojekte des TRR356, den Laboralltag, wissenschaftliche Werdegänge und Entdeckungen.

  • 16 episodes
  • Updated April 16

Episodes16

  • April 16 · 45 min

    #16 Wo Botanik sichtbar wird: Forschung, Sammlung und Vermittlung im Botanischen Garten – Mit Dr. Thibaud Messerschmid

    Mehr zum Thema: Wissenschaftliche Publikationen von Dr. Thibaud Messerschmid Aktuelles Veranstaltungsprogramm des Botanischen Gartens München-Nymphenburg Forschungsschwerpunkte des Botanischen Gartens München-Nymphenburg Hann DR, Kadereit G (2025) Cultivating awareness: How botanical gardens can foster public engagement with plant pathogens. PLOS Pathogens 21(10): e1013629. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013629

  • April 2 · 44 min

    #15 Von der Zelle zum Publikum: Korallen-Symbiose zwischen Labor und Öffentlichkeit – Mit Prof. Dr. Annika Guse

    Transparenzhinweis: Prof. Dr. Annika Guse hat an dem in dieser Folge besprochenen Kinderbuch Hallo Plankton! (ab Minute 36:00) als wissenschaftliche Beratung mitgewirkt. Die Empfehlung erfolgt aus ihrer persönlichen Sicht. Eine bezahlte Werbekooperation mit unserem Podcast liegt nicht vor. Mehr zum Thema: Publikationen aus dem GuseLab Projektwebsite ¡vamos, simbiosis! Hallo Plankton! Nominierung für den Deutschen Jugendliteraturpreis 2025 – Jurybegründung

  • March 5 · 46 min

    #13 Tracing Adaptation: Population Genetics meets Plant Pathology – With Prof. Dr. Ralph Hückelhoven and Prof. Dr. Aurélien Tellier

    More about this topic: Bourque G, Burns KH, Gehring M, Gorbunova V, Seluanov A, Hammell M, Imbeault M, Izsvák Z, Levin HL, Macfarlan TS, Mager DL, Feschotte C. Ten things you should know about transposable elements. Genome Biol. 2018 Nov 19;19(1):199. doi: 10.1186/s13059-018-1577-z. https://link.springer.com/article/10.1186/s13059-018-1577-z Cornille, A., Ebert, D., Stukenbrock, E., Rodriguez de la Vega, R.C., Tiffin, P., Croll, D., and A. Tellier (2022) Unraveling coevolutionary dynamics using ecological genomics, Trends Genet, Volume 38, Issue 10, 1003 - 1012 https://doi.org/10.1016/j.tig.2022.05.008 Horvath R., Minadakis N., Bourgeois Y., and AC Roulin (2024) The evolution of transposable elements in Brachypodium distachyon is governed by purifying selection, while neutral and adaptive processes play a minor role eLife 12:RP93284, https://doi.org/10.7554/eLife.93284.3 Müller MC, Brumm S, Hu Y, Kemen E, Lahaye T, Hückelhoven R (2026) Diversify and conquer: How effector diversity is shaped by host–microbe co-evolution. PLOS Pathog. 22: e1013870. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1013870 Nottensteiner M, Zechmann B, McCollum C, Hückelhoven R (2018) A Barley powdery mildew fungus non-autonomous retrotransposon encodes a peptide that supports penetration success on barley. J. Exp. Bot. 69:3745-3758.

  • February 19 · 26 min

    #12 Microscopic Enemies: How Geminiviruses interact with Plants - With Shaojun Pan

    More about this topic: Pan S, Wei H, Dröst F, Fenn A, Kamal N, Lozano-Durán R. Viral proteins as discovery tools for cell biology: The case of the geminivirus-encoded C4. PLoS Pathog. 2026 Jan 5;22(1):e1013798. doi: 10.1371/journal.ppat.1013798. PMID: 41490275; PMCID: PMC12768228. Jin L, Chen M, Xiang M, Guo Z. RNAi-Based Antiviral Innate Immunity in Plants. Viruses. 2022 Feb 20;14(2):432. doi: 10.3390/v14020432. PMID: 35216025; PMCID: PMC8875485. Jin Y, Zhao JH, Guo HS. Recent advances in understanding plant antiviral RNAi and viral suppressors of RNAi. Curr Opin Virol. 2021 Feb;46:65-72. doi: 10.1016/j.coviro.2020.12.001. Epub 2020 Dec 25. PMID: 33360834. Li F, Li X, Zhao S, Pan F, Li Z, Hao Y, He J, Wang A, Kormelink R, Zhou X. Antiviral RNA interference in plants: Increasing complexity and integration with other biological processes. Plant Commun. 2025 Oct 13;6(10):101490. doi: 10.1016/j.xplc.2025.101490. Epub 2025 Aug 26. PMID: 40873037; PMCID: PMC12546453. Medina-Puche L, Orílio AF, Zerbini FM, Lozano-Durán R. Small but mighty: Functional landscape of the versatile geminivirus-encoded C4 protein. PLoS Pathog. 2021 Oct 7;17(10):e1009915. doi: 10.1371/journal.ppat.1009915. PMID: 34618877; PMCID: PMC8496806. Chikoti PC, Mulenga RM, Tembo M, Sseruwagi P. Cassava mosaic disease: a review of a threat to cassava production in Zambia. J Plant Pathol. 2019;101(3):467-477. doi: 10.1007/s42161-019-00255-0. Epub 2019 Feb 12. PMID: 31983872; PMCID: PMC6951474.

  • Sep 11, 2025 · 35 min

    #10 Von Genetik zu Genomik: Welchen Einfluss haben Gene auf das pflanzliche Mikrobiom? – Mit Dr. Niklas Schandry

    Mehr zum Thema: In der Folge erwähnte Publikation: Schandry, N., & Becker, C. (2020). Allelopathic plants: Models for studying plant–interkingdom interactions. Trends in Plant Science, 25(2), 176–185. https://doi.org/10.1016/j.tplants.2019.11.004 Publikation: Janse van Rensburg, H., Schandry, N., Waelchli, J., Stengele, K., Cadot, S., Adachi, H., Jandrasits, K., Becker, C., & Schlaeppi, K. (2025, Juli 1). A TNL receptor mediates microbiome feedbacks in Arabidopsis (Version 3) [Preprint]. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2025.02.25.640125 Neueste Publikation: Schandry, N., & Becker, C. (2025, August 14). The scent of a crowd. Science, 389(6761), 680–681. https://doi.org/10.1126/science.adz7633

  • Aug 28, 2025 · 22 min

    #9 Von Molekülen zu Melodien: Wie lassen sich biologische Strukturen hörbar machen? - Mit Dr. Nora Eifler

    Anmerkungen zur Folge: Im Hintergrund sind nach dem Intro folgende vertonte Proteine zu hören (entsprechend der Reihenfolge): SymRK FLS2 Insulin B chain Rubisco Flg22 AQP6 Alcohol Dehyrogenase Nora Eifler hat in der Strukturbiologie strukturelles Denken gelernt - also das Denken in Strukturmotiven, was sich prima auf die Musik übertragen lässt. Mit Wassertransport meinte sie Wasseraustausch. Nora Eifler auf YouTube: @Proteintunes Channel YouTube Video: Celebrating our talents for Eurovision - Nora's story von Novartis Nora Eiflers Musik auf Soundcloud: www.soundcloud.com/nora-eifler

  • Aug 14, 2025 · 41 min

    #8 Digital entschlüsselt: Was verraten Genomdaten über die pflanzliche Immunabwehr? - Mit Prof. Dr. Korbinian Schneeberger

    Mehr zum Thema: Publikation des Biologie-inspirierten Algorithmus: Goel, M., Sun, H., Jiao, WB. et al. SyRI: finding genomic rearrangements and local sequence differences from whole-genome assemblies. Genome Biol 20, 277 (2019). https://doi.org/10.1186/s13059-019-1911-0 Kürzliche Publikation zu Mutationsraten: Dong, X., Jiao, W.-B., Campoy, J. A., Rabanal, F., Ton, J., Smith, L. M., Weigel, D., & Schneeberger, K. (2025). The mutational dynamics of the Arabidopsis centromeres [Preprint]. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2025.06.02.657473v1 Schneeberger Lab: Website Mehr zu Frederick Sanger, z.B. bei Deutschlandfunk (2018): 100. Geburtstag, Frederick Sanger – der Mann mit den zwei Nobelpreisen Buchempfehlung: Die Neandertaler und wir von Svante Pääbo - Buchbesprechung u.a. bei MDR Wissen (2024) Anmerkung zur Folge: Es gibt vier Einzelpersonen, die mehr als einen Nobelpreis gewonnen haben: Marie Curie (1903: Physik und 1911: Chemie), Linus Pauling (1954: Chemie und 1962: Frieden), John Bardeen (1956 und 1972, beide Physik) und Frederick Sanger (1958 und 1980, beide Chemie). Zusätzlich zu den Einzelpersonen haben auch Organisationen mehrmals den Friedensnobelpreis erhalten, wie das Internationale Komitee vom Roten Kreuz. Zum Nachlesen, z.B. Nobelpreis-Rekorde, Deutsche Welle (2013)

  • Jul 31, 2025 · 25 min

    #7 Zwischen Angriff und Abwehr: Was passiert, wenn Pflanzen von Mehltau befallen werden? - Mit Henriette Leicher

    Mehr zum Thema: Publikation: Hückelhoven, R., & Panstruga, R. (2011). Cell biology of the plant‑powdery mildew interaction. Current Opinion in Plant Biology, 14(6), 738–746. https://doi.org/10.1016/j.pbi.2011.08.002 Publikation: Micali C, Göllner K, Humphry M, Consonni C, Panstruga R. The Powdery Mildew Disease of Arabidopsis: A Paradigm for the Interaction between Plants and Biotrophic Fungi. Arabidopsis Book. 2008;6:e0115. doi: 10.1199/tab.0115. Epub 2008 Oct 2. PMID: 22303240; PMCID: PMC3243333. Publikation: Cheung, A. Y. (2024). FERONIA: A receptor kinase at the core of a global signaling network. Annual Review of Plant Biology, 75, 345–375. https://doi.org/10.1146/annurev-arplant-102820-103424 Publikation: Zhang, X., Yang, Z., Wu, D., & Yu, F. (2020). RALF–FERONIA signaling: Linking plant immune response with cell growth. Plant Communications, 1(4), Article 100084. https://doi.org/10.1016/j.xplc.2020.100084

  • Jul 17, 2025 · 43 min

    #6 Kleines ganz groß: Welche Rolle spielt Elektronenmikroskopie in der Pflanzenforschung? - Mit Prof. Dr. Andreas Klingl

    Mehr zum Thema: Publikation: Seydel, C., Heß, M., Schröder, L., Klingl, A., & Nägele, T. (2025). Subcellular plant carbohydrate metabolism under elevated temperature. Plant physiology, 198(3), kiaf117. https://doi.org/10.1093/plphys/kiaf117 Publikation: Lübben, M. K., Klingl, A., Nickelsen, J., & Ostermeier, M. (2024). CLEM, a universal tool for analyzing structural organization in thylakoid membranes. Physiologia plantarum, 176(4), e14417. https://doi.org/10.1111/ppl.14417 Publikation: Kalvelage, J., Wöhlbrand, L., Schoon, R. A., Zink, F. M., Correll, C., Senkler, J., Eubel, H., Hoppenrath, M., Rhiel, E., Braun, H. P., Winklhofer, M., Klingl, A., & Rabus, R. (2023). The enigmatic nucleus of the marine dinoflagellate Prorocentrum cordatum. mSphere, 8(4), e0003823. https://doi.org/10.1128/msphere.00038-23 Publikation: Cerri, M. R., Wang, Q., Stolz, P., Folgmann, J., Frances, L., Katzer, K., Li, X., Heckmann, A. B., Wang, T. L., Downie, J. A., Klingl, A., de Carvalho-Niebel, F., Xie, F., & Parniske, M. (2017). The ERN1 transcription factor gene is a target of the CCaMK/CYCLOPS complex and controls rhizobial infection in Lotus japonicus. The New phytologist, 215(1), 323–337. https://doi.org/10.1111/nph.14547

  • Jul 3, 2025 · 20 min

    #5 Rooted in Symbiosis: How Plants and Microbes Work Together - With Tora Fougner-Økland and Jonathan Jelen

    Notes on the discussed symbioses: Arbuscular mycorrhizal (AM) symbiosis is a mutualistic association between the roots of most terrestrial plants and fungi from the phylum Glomeromycota. In this relationship, the fungi colonize plant roots and extend their hyphae into the soil, enhancing water and nutrient uptake - particularly phosphorus - while receiving sugars and lipids produced by the plant through photosynthesis. This ancient and widespread symbiosis plays a crucial role in plant health, soil fertility, and ecosystem stability. Legume root nodule symbiosis is a mutualistic interaction between leguminous plants and nitrogen-fixing bacteria, primarily from the genus Rhizobium. The bacteria infect plant roots and form specialized structures called nodules, where they convert atmospheric nitrogen into a form the plant can use for growth. In return, the plant supplies the bacteria with malate and a protective environment. There are some examples where stem nodules are formed. Sesbania for example is a genus of leguminous plants that includes species capable of forming stem nodules - a relatively rare and specialized type of symbiosis with nitrogen-fixing bacteria.